此論偈頌結構大分為五個部份，第一部份「道前根基」，這是為行者先紮下學法的根底，建立正確的修行態度，塑成一位真能受法的修行法器。

第二部份「釋題玄義」從解釋題目中，講說全論玄妙義理，是總說全論精髓，根熟者聞此即得悟入全論法要。

第三部份序分「淨土加行道」，這是論文之序幕，依苦空無常無我的教法架構，深入闡述大、小乘佛法修行次第，主要為令淨業行者欣求極樂，厭離娑婆奠定看破放下之堅固道基。

從序分淨土加行道開始至後面流通分勝義菩提道的部份，於前時講解六場大

綱論文要義時，曾寫有一樹狀大綱科判，依古德經開三分之判而設立，是為便於掌握全論綱要結構。而此處目錄上所標之四十六首偈頌結構，則總分為五大科，於每二首偈中再各另立一小標題示之要旨，此則有助於理解偈頌之要義。

第四部分正宗分「即身成佛道」，這是此論的核心教法，說明一生成佛的易行修法，現前及往生後成就之果德，以及建立往生信心後在生活中三類不同層次的行持。

第五部分流通分「勝義菩提道」，既是勝義就不是普通的菩薩道，而是學持法身大士從空性之理而起用，在現前具體依普賢十願行四攝六度的方法。就華嚴的境界來講，一法中具一切法，此部論亦含攝一切世出世間法，法法圓融互攝無礙，所謂是圓人修法，無法不圓，依佛果地圓教之理而起修，所感之果必是圓滿無缺，這就是淨土法門依佛力起修易行而圓滿之無上微妙處。